Pour pratiquer zazen, on se met dans la posture du lotus, chaque pied étant posé sur la cuisse opposée (ou du demi-lotus, avec un seul pied sur la cuisse opposée, selon ses possibilités). On peut aussi utiliser la posture birmane : une des deux jambes reste sur le sol, le talon près de l’entre-jambe, l’autre est simplement posée devant la première. Quelle que soit la posture choisie, il est important que les genoux (ou au moins un des deux) prennent appui sur le sol. Dans cette assise ferme, on tend sa colonne vertébrale, la tête pousse le ciel, le menton est rentré dans le cou ; le regard est posé à 45° devant soi, de façon à ne pas provoquer de tension dans les muscles des yeux (qui restent donc ouverts). On place la main gauche sur la main droite, les paumes sont tournées vers le haut, les pouces se touchent légèrement.

Durant zazen, la respiration est calme et profonde, elle part du hara, le centre vital de l’être humain situé en-dessous du nombril.

La posture de l'assise telle que décrite par l'Association zen internationale